レイヤーパネルが表示されなくなった；
メニューのウィンドウ(W)からたどっても開かない；
F7押してもダメorz

illustator期設定ファイル （AIPrefs）削除して起動することでパネルが初期化されるようだ。
ファイルはココ

Documents and Settings\[username]\Applicaition Data\Adobe\Adobe Illustrator [Version]\AIprefs

参考ページ
http://support.adobe.co.jp/faq/faq/qadoc.sv?219156+002